Behandeling van kinkhoestinfecties zijn alleen zinvol indien dit in het catarrhale stadium gebeurt. Om de transmissie naar jonge zuigelingen (leeftijd tot een jaar) in het gezin te voorkómen is het ook in latere stadia van de ziekte geindiceerd behandeling/chemoprofylaxe aan gezinsleden aan te bieden.

In de literatuur wordt ook een behandelduur van 5 dagen bij het gebruik van azitromycine aangehouden.

Bij twijfel aan de diagnose kan beter gestart worden met claritromycine i.v.m. de kortere halfwaardetijd van het antibioticum. Na bevestiging van de diagnose kan geswitched worden naar azitromycine.